מסוף התחבורה העירוני נבנה בתוך כיכר התחבורה הראשית של העיר, והוא יפעל בשתי קומות כך שהקומה העליונה מיועדת עבור התחבורה העירונית והקומה התחתונה מיועדת לתחבורה הבין עירונית. בקומה התחתונה הותקנו רציפי האוטובוסים, כאשר הכניסה והיציאה של האוטובוסים מהמתחם היא מהכיכר. המסוף החדש נבנה כך שתהיה גישה אליו וממנו הן לקניון עזריאלי והן לתחנת הרכבת “מודיעין מרכז”. בעתיד תהיה גישה ישירה גם עבור באי השדרה המרכזית, המע”ר, ההולכת ומוקמת בימים אלה. שטח המסוף עצמו הוא כ3,000 מ”ר והוא כולל אולם נוסעים בגודל של כ-1100 מ”ר, שטח מעבר מקורה בין תחנת האוטובוסים לרכבת בגודל של כ-1100 מ”ר ושטח מסחרי בגודל של כ-720 מ”ר.